在現(xiàn)代化的計算機網(wǎng)絡(luò)體系下，連鎖藥店管理軟件要求強化統(tǒng)一配送職能，以便對各連鎖藥店的藥品品種與數(shù)量了如指掌，并及時調(diào)劑、補充貨源，連鎖藥店管理軟件的應(yīng)用和更新，不僅使得企業(yè)通過認證要求，使得連鎖藥店更加統(tǒng)一化、標準化、實現(xiàn)利益共享。
(一)思想認識不統(tǒng)一、不全面不統(tǒng)一、不全面
本來，連鎖經(jīng)營的連鎖方追求的是規(guī)模效益，而被連鎖方追求的是無本效益;連鎖方領(lǐng)先被連鎖方的網(wǎng)絡(luò)、場地、門面、人力等以延伸市場，被連鎖方依靠連鎖方輸送商品、管理方式、經(jīng)營理念等抗擊風(fēng)波。雙方原本是相互合作、相互依靠、互惠互利、缺一不可的，但在實際發(fā)展過程中，連鎖方往往將自己看作主體，主宰著被連鎖方，總認為被連鎖方贏得的利潤是自己"施舍"的。
兼有直屬門市、與其他單位或個人合作的連鎖藥店的藥品零售企業(yè)往往只把直屬門市看作自己的"孩子"，把與其他單位或個人合作的連鎖藥店當作"收養(yǎng)的"，總是把緊銷藥品、先進設(shè)備、管理方式輸送給自己的直屬門市，致使連鎖藥店成了旁系，成了"后媽生的"。這樣就造成連鎖藥店與直屬門市之間的不公平競爭，進而導(dǎo)致連鎖藥店的激情逐漸減退。在這種片面認識的影響下，連鎖藥店很難得到發(fā)展，連鎖經(jīng)營的形式很難真正得到推廣。
對策：連鎖經(jīng)營，是藥品零售企業(yè)在商品微利時代到來的必然選擇。藥店進行連鎖經(jīng)營一起步就應(yīng)規(guī)范化運作，強調(diào)"六統(tǒng)一"，走集約化經(jīng)營。連鎖雙方應(yīng)明白，不管是何種形式的連鎖(直營、加盟、特許等)，都是為打破行業(yè)、部門、地區(qū)及所有制界限，提高連鎖的規(guī)模和規(guī)范化水平，取得規(guī)模效益，最終實現(xiàn)"雙贏"的目的。因此，藥店的連鎖方與被連鎖方是在平等基礎(chǔ)上的合作關(guān)系，不分誰主誰副，不是主宰與被主宰的關(guān)系。
(二)人才奇缺且分布不均
藥品實行分類管理以后，藥品零售企業(yè)對從業(yè)人員專業(yè)技術(shù)水平的要求提高，因此有的藥品零售企業(yè)為通過GSP達標，爭取進入分類管理試點單位，成為定點藥房，將大部分專業(yè)技術(shù)、經(jīng)營管理人才統(tǒng)統(tǒng)抽調(diào)到規(guī)模較大的重點門市，致使小門市、"旁系"的連鎖藥店的專業(yè)技術(shù)和經(jīng)營管理人才奇缺。個別連鎖藥店雖然有管理人員，但一個管理人員分別管轄七八個連鎖分店，占線從城市拉到農(nóng)村，僅送貨、退貨就忙得不亦樂乎，根本就顧不上管理與指導(dǎo)。
執(zhí)業(yè)藥師更是奇缺。如某市藥業(yè)集團公司(批零兼營)有10個直屬門市，15個連鎖藥店，可執(zhí)業(yè)藥師僅1人，藥師3人，藥士也不足10人。
對策：為解決藥品管理方面人才奇缺問題，培訓(xùn)藥品連鎖經(jīng)營各層次人才尤其是高級管理人才是當務(wù)之急。連鎖總部可通過內(nèi)部訓(xùn)練、委托醫(yī)藥大學(xué)培養(yǎng)、外派參觀考察等多種方式培養(yǎng)人才。連鎖總部對人才在各分店的分布也應(yīng)根據(jù)實際情況力求均勻，在重視大藥店的同時要兼顧到小藥店的發(fā)展。 對于執(zhí)業(yè)藥師的短缺問題，藥業(yè)公司可通過內(nèi)部培訓(xùn)和招聘方式解決。公司可鼓勵本單位內(nèi)部有一定學(xué)歷和技術(shù)的年輕人參加執(zhí)業(yè)藥師資格考試，并對其提供一定的學(xué)習(xí)條件如，留有一定的復(fù)習(xí)時間，報銷報名費、學(xué)費等。對于考上執(zhí)業(yè)藥師的人員，公司要從待遇上體現(xiàn)出來。
(三)法律、合同、契約意識淡薄
由于目前還沒有有關(guān)連鎖經(jīng)營(如專利法)的法律出臺，部分連鎖藥店法律意識淡薄，漠視合同與契約，所以連鎖方許多"專利"公開推廣后得不到保護。如有些被連鎖方在接受連鎖方培訓(xùn)、指導(dǎo)甚至在連鎖方為自己辦好一切證照使自己步入正規(guī)后突然翻臉，以種種理由過河拆橋，掙脫連鎖束縛，另起爐灶。殊不知，這會給自己造成很大的損失。被連鎖方自立門戶，勢必造成經(jīng)營成本、管理費用、商品進價的增加，導(dǎo)致被連鎖方整體利益流失。
有的連鎖藥店雖未另起爐灶，但有名無實，打著連鎖總店的招牌自組貨源、自定價格、自行銷售，致使連鎖藥店該"統(tǒng)一"的沒統(tǒng)一，該標準化的沒標準化，名連而實不連，連而不鎖，從而失去連鎖的意義。
對策：由于我國還未出臺連鎖協(xié)議方面的立法，連鎖方與被連鎖方應(yīng)通過合同與契約等有關(guān)規(guī)章制度來互相約束，以增強連鎖雙方之間的協(xié)作、競爭、法律意識，并明確雙方的權(quán)利與義務(wù)，利益與風(fēng)險。在此基礎(chǔ)上，管理人員應(yīng)強化對各連鎖藥店的監(jiān)督功能，對違紀、違規(guī)、違反合同的行為及時查處;在藥品上貼上條形碼或其他防偽標志，以杜絕私貨及由投訴而引起的不必要的糾紛。 若協(xié)議簽得不規(guī)范，一方不遵守規(guī)章制度，就很難保證連鎖雙方的利益。因此，增強連鎖藥店經(jīng)營立法迫在眉睫，這是約束和規(guī)范藥店連鎖經(jīng)營最有效的手段。
(四)基礎(chǔ)設(shè)施差、規(guī)模小
目前由于我國總體經(jīng)濟發(fā)展水平不高，連鎖方與被連鎖方幾乎沒有計算機網(wǎng)絡(luò)，靠電話或車輛傳遞信息，這使得很多藥店之間的連鎖僅僅是形式與表象，致使連鎖方無法進行整體布局與宏觀調(diào)控，無法針對性地管理。個別連鎖方為謀求規(guī)模效益只圖連鎖數(shù)量不重視質(zhì)量，將營業(yè)員素質(zhì)、基礎(chǔ)設(shè)施差的藥店也拉入自己的麾下，以致影響和制約了連鎖總店的發(fā)展與整體素質(zhì)的提高。有部分連鎖藥店數(shù)量不足，各項成本費用與利潤還達不到盈虧平衡點，根本談不上規(guī)模效益。
對策：自動化程度的高低是決定藥店連鎖是否成功的一個重要標志。為實現(xiàn)計算機聯(lián)網(wǎng)、全面實施條形碼制度，連鎖藥店應(yīng)爭取政府貸款或吸引資金雄厚的經(jīng)濟實體或個人投資、加盟、入股等方式增加硬件設(shè)施建設(shè)，迅速擴大規(guī)模，使之向著規(guī)范化、標準化發(fā)展，這樣有利于解決連鎖經(jīng)營發(fā)展過程中及今后遇到的一系列困難與矛盾。
(五)配送中心功能不健全
不少連鎖藥店沒有建立物流配送中心與計算機信息管理系統(tǒng)，因此不能及時知曉各門市缺貨品種與數(shù)量，也就不能及時補充貨源與調(diào)劑商品，更無法合理進貨。有的連鎖藥店雖有配送中心，但配送中心僅起一個送貨的作用，并不能起到養(yǎng)護商品、退換貨、調(diào)劑商品、處理過期商品、失效商品的作用、為解決連鎖經(jīng)營在發(fā)展過程中遇到的一系列矛盾和問題，并為入世做好準備。
對策：連鎖經(jīng)營是商流、物流、信息流的綜合管理過程。只有通過現(xiàn)代化的計算機網(wǎng)絡(luò)體系建立暢通的信息管理系統(tǒng)，并在被連鎖方的密切配合下才能為經(jīng)營決策及時提供可靠的依據(jù)。信息管理包括對商品品種、數(shù)量的搜集管理、上報，對同行業(yè)價格行情的搜集，對擁護反饋信息的整理，對各連鎖藥店經(jīng)營情況等一系列信息的收集、分析、傳遞、使用，并進行反饋等。
